一、公诉案证据不足还会民事赔偿吗？
公诉案件中证据不足的，公安机关有权撤案。公安机关撤销的只是刑事责任部分，并不影响当事人追究民事赔偿部分，当事人就有关民事赔偿有权向人民法院起诉。
法院在审理公诉案件时，认为证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。需要特别说明的是：退回补充侦察只能由检察院提出申请，法院核准是否同意，不会是法院提出退回侦察。在刑事诉讼中，检察院是控方、被告人是被控方，如果法院再成为控方，法律的公正如何体现。
相关法律依据：
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百九十五条，在被告人最后陈述后，审判长宣布休庭，合议庭进行评议，根据已经查明的事实、证据和有关的法律规定，分别作出以下判决：
(一)案件事实清楚，证据确实、充分，依据法律认定被告人有罪的，应当作出有罪判决；
(二)依据法律认定被告人无罪的，应当作出无罪判决；
(三)证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。
二、公诉案件主要有哪些？
所谓公诉案件，亦即刑事公诉案件，是指由各级检察机关依照法律相关规定，代表国家追究被告人的刑事责任而提起诉讼的案件
公诉案件是指除了自诉以外的所有案件，人民法院直接受理的自诉案件包括：
(一)告诉才处理的案件：
1、侮辱、诽谤案
2、暴力干涉婚姻自由案
3、虐待案
4、侵占案
(二)人民检察院没有提起公诉，被害人有证据证明的轻微刑事案件：
1、故意伤害案
2、非法侵入住宅案
3、侵犯通信自由案
4、重婚案
5、遗弃案
6、生产、销售伪劣商品案
7、侵犯知识产权案
8、属于刑法分则第四章、第五章规定的，对被告人可能判处三年有期徒刑以下刑罚的案件
对上列八项案件，被害人直接向人民法院起诉的，人民法院应当依法受理对于其中证据不足、可由公安机关受理的，或者认为对被告人可能判处三年有期徒刑以上刑罚的，应当移送公安机关立案侦查
(三)被害人有证据证明对被告人侵犯自己人身、财产权利的行为应当依法追究刑事责任，而公安机关或者人民检察院已经作出不予追究的书面决定的案件。
综上所述，公诉案件经过查证由于证据不足无法立案的，应当立即撤销并对当事人无罪释放，但是如果当事人存在民事责任，仍旧需要承担相应民事侵权赔偿责任，存在争议的可以向人民法院另行提起民事诉讼，经人民法院审理属实的，依法作出判决裁定。